علی مطهری در یادداشتی که توسط خبرگزاری ایسنا منتشر شد٬ نوشت: «شعار‌های طلاب علوم دینی در تجمع آخر هفته گذشته در مدرسه فیضیه قم موجب نگرانی برای حوزه علمیه قم از نظر سطح فکر و سیاست بخشی از طلاب این حوزه شد.»

به نوشته نایب رییس مجلس «شعار‌هایی که در تجمع مدرسه فیضیه قم سر داده شد یا روی تابلو‌ها حمل می‌شد، نشان می‌دهد که لااقل بخشی از حوزه علمیه قم از نظر بینش اجتماعی و سیاسی دچار انحطاط شده است.»

او در بخش دیگری از این یادداشت تاکید کرد: «تاسف انسان افزایش می‌یابد زمانی که در می‌یابیم که این افراد ابزار دست یک گروه سیاسی واقع شدند و روی دسته پلاکارد‌های آن‌ها نوشته شده بود: لطفا تابلو‌ها را بعد از مراسم تحویل دهید.»

این عوض فراکسیون مجلس در ادامه نوشت: «تاسف بیشتر زمانی به انسان دست می‌دهد که می‌بیند یکی از شعار‌هایی که روی تابلو حمل می‌شد، این بود:‌ای آنکه مذاکره شعارت/ استخر فرح در انتظارت، اشاره به رحلت آیت الله هاشمی رفسنجانی.»

او افزود: «این شعار می‌تواند سرنخی برای نحوه فوت آن مرحوم باشد که برای بسیاری از اذهان به صورت یک معما باقی مانده است. در واقع مفهوم این شعار این است که آقای رئیس‌جمهور، ما همانطور که سر آقای هاشمی را زیر آب کردیم سر تو را هم زیر آب خواهیم کرد. وزارت اطلاعات باید این موضوع را پیگیری و نتیجه را به اطلاع ملت برساند. شاید ماجرای فوت ناگهانی و غیرقابل باور رییس فقید مجمع تشخیص مصلحت نظام نیز روشن شود.»

همچنین رضا سیار٬ فرماندار قم٬ درباره تجمع روز پنجشنبه تعدادی از طلاب در مدرسه فیضیه قم به ایلنا گفت: «ما این اتفاق را از طریق گزارش به مقامات ارشد استان دنبال می‌کنیم. من روز پنجشنبه گزارش حاشیه‌ها و شعار‌هایی که در تجمع طلاب در مدرسه فیضیه قم اتفاق افتاد را به استانداری اعلام کردم. اکنون نیز دستگاه‌های اطلاعاتی و امنیتی پیگیری کنند.»
فرماندار قم در ادامه تاکید کرد که گزارشی از شعار‌های تهدیدآمیز تجمع طلاب در مدرسه فیضیه قم را به مقامات ارشد استان ارسال کرده است و دستگاه‌های امنیتی به این اتفاق رسیدگی خواهند کرد.